1、進(jìn)倉報(bào)關(guān)
保稅倉庫貨物進(jìn)境入倉時(shí)，除易制毒化學(xué)品、監(jiān)控化學(xué)品、消耗臭氧層物質(zhì)外，免領(lǐng)進(jìn)口許可證件。
(1)如果倉庫主管海關(guān)與進(jìn)境口岸不是同一直屬海關(guān)的，按轉(zhuǎn)關(guān)方式來辦理，可以按“提前報(bào)關(guān)轉(zhuǎn)關(guān)方式”申報(bào)，也可以按“直轉(zhuǎn)轉(zhuǎn)關(guān)方式”申報(bào)。
(2)如果倉庫主管海關(guān)與進(jìn)境口岸是同一直屬海關(guān)的，經(jīng)批準(zhǔn)，可以不按轉(zhuǎn)關(guān)運(yùn)輸方式辦理，由經(jīng)營企業(yè)直接在口岸海關(guān)辦理報(bào)關(guān)手續(xù)，口岸海關(guān)放行后，企業(yè)自行提取貨物入倉。
2、出倉報(bào)關(guān)
保稅倉庫貨物出倉可能出現(xiàn)進(jìn)口報(bào)關(guān)(進(jìn)入國內(nèi)市場)和出口報(bào)關(guān)(復(fù)運(yùn)出口)。
(1)出口報(bào)關(guān)：保稅倉庫出倉復(fù)運(yùn)出境貨物，應(yīng)當(dāng)按轉(zhuǎn)關(guān)運(yùn)輸方式辦理出倉手續(xù)。是同一直屬海關(guān)的，經(jīng)批準(zhǔn)，可以不按轉(zhuǎn)關(guān)運(yùn)輸方式辦理。
(2)進(jìn)口報(bào)關(guān)
轉(zhuǎn)為正式進(jìn)口的同一批貨物，要填制兩張報(bào)關(guān)單，一張辦結(jié)出倉報(bào)關(guān)手續(xù)，由保稅倉庫經(jīng)營企業(yè)填制出口貨物報(bào)關(guān)單。另一張辦理進(jìn)口申報(bào)手續(xù)，按照實(shí)際進(jìn)口監(jiān)管方式，填制進(jìn)口貨物報(bào)關(guān)單。進(jìn)口手續(xù)大體分為：
①保稅倉庫貨物出倉用于加工貿(mào)易的，由加工貿(mào)易企業(yè)或其代理人按保稅加工貨物的報(bào)關(guān)程序辦理進(jìn)口報(bào)關(guān)手續(xù)。
②保稅倉庫貨物出倉作為特定減免稅貨物的，由享受特定減免稅的企業(yè)按特定減免稅貨物的報(bào)關(guān)程序辦理進(jìn)口報(bào)關(guān)手續(xù)。
③保稅倉庫貨物出倉進(jìn)入國內(nèi)市場，由保稅倉庫經(jīng)營企業(yè)按一般進(jìn)口貨物的報(bào)關(guān)程序辦理進(jìn)口報(bào)關(guān)手續(xù)。
④保稅倉庫內(nèi)的寄售維修零配件申請(qǐng)以保修期內(nèi)免費(fèi)出倉的，由保稅倉庫經(jīng)營企業(yè)辦理進(jìn)口報(bào)關(guān)手續(xù)，填制進(jìn)口報(bào)關(guān)單，貿(mào)易方式欄填“無代價(jià)抵償貨物”，并確認(rèn)免稅出倉的維修件在保修期內(nèi)不超過原設(shè)備進(jìn)口之日起3年。
(3)集中報(bào)關(guān)：保稅貨物出庫批量少批次頻繁，經(jīng)海關(guān)批準(zhǔn)可以辦理定期集中報(bào)關(guān)手續(xù)。
3、流轉(zhuǎn)報(bào)關(guān)
(1)保稅倉庫與特殊監(jiān)管區(qū)域之間往來流轉(zhuǎn)的貨物，按轉(zhuǎn)關(guān)運(yùn)輸?shù)挠嘘P(guān)規(guī)定辦理，保稅倉庫與特殊監(jiān)管區(qū)域?qū)儆谕轮睂訇P(guān)區(qū)內(nèi)的，可不按轉(zhuǎn)關(guān)運(yùn)輸辦理。
(2)保稅倉庫貨物轉(zhuǎn)往其他保稅倉庫的，應(yīng)當(dāng)各自在倉庫主管海關(guān)報(bào)關(guān)，報(bào)關(guān)時(shí)先辦理進(jìn)口報(bào)關(guān)，再辦理出口報(bào)關(guān)。