(1)遺失手冊的合同報核
企業(yè)遺失加工貿(mào)易手冊應(yīng)當(dāng)及時向主管海關(guān)報告。主管海關(guān)及時移交緝私部門按規(guī)定進(jìn)行處理。緝私部門處理后，企業(yè)應(yīng)當(dāng)持以下單證向主管海關(guān)報核：
①經(jīng)營企業(yè)關(guān)于加工貿(mào)易手冊遺失的書面報告；
②經(jīng)營企業(yè)申請核銷的書面材料；
③加工貿(mào)易貨物進(jìn)出口報關(guān)單；
④緝私部門出具的“行政處罰決定書”；
⑤海關(guān)按規(guī)定需要收取的其他單證和材料。
(2)遺失進(jìn)出口貨物報關(guān)單的合同報核
按規(guī)定企業(yè)應(yīng)當(dāng)用報關(guān)單留存聯(lián)報核，在遺失報關(guān)單的情況下，可以憑報關(guān)單復(fù)印件向原報關(guān)地海關(guān)申請加蓋海關(guān)印章后報核。
(3)無須申領(lǐng)手冊的5000美元及以下的78種列名服裝輔料的合同報核企業(yè)直接持進(jìn)出口貨物報關(guān)單、合同、核銷核算表報核。報核的出口貨物報關(guān)單應(yīng)當(dāng)是注明備案編號的一般貿(mào)易出口貨物報關(guān)單。
(4)撤銷合同報核
加工貿(mào)易合同備案后因故提前終止執(zhí)行，未發(fā)生進(jìn)出口而申請撤銷的，應(yīng)報商務(wù)主管部門審批，企業(yè)憑審批件和手冊報核。
(5)有走私違規(guī)行為的加工貿(mào)易合同報核
加工貿(mào)易企業(yè)因走私行為被海關(guān)緝私部門或者法院沒收保稅加工貨物的，憑相關(guān)證明材料，如“行政處罰決定書”、“行政復(fù)議決定書”、“判決書”、“裁決書”等向海關(guān)報核。
加工貿(mào)易企業(yè)因違規(guī)等行為被海關(guān)緝私部門或法院處以警告、罰款等處罰但不沒收保稅加工貨物的，不予免除加工貿(mào)易企業(yè)辦理相關(guān)海關(guān)手續(xù)的義務(wù)。