一、申報。保稅貨物在保稅倉庫所在地入境時，貨主或其代理人持下列單證向海關(guān)申報：（1）《進口貨物報關(guān)單》一式三份。報關(guān)單上須加蓋“保稅貨物”印章并注明貨物存入某地保稅倉庫；（2）經(jīng)主管海關(guān)核發(fā)的《保稅倉庫登記證書》。辦理《保稅倉庫登記證書》的手續(xù)為：申請建立保稅倉庫的單位經(jīng)理人，持國家工商行政管理部門核發(fā)的營業(yè)執(zhí)照、填寫的《保稅倉庫申請書》及省以上對外經(jīng)貿(mào)行政管理部門批準經(jīng)營有關(guān)業(yè)務(wù)的批件，向主管海關(guān)申報，經(jīng)海關(guān)審核并派員實地調(diào)查，認為符合條件后，批準建立保稅倉庫并頒發(fā)登記證書；（3）如進口貨物列入國家商檢機構(gòu)實施檢驗出口商品種類表的，須提交商檢證書。
保稅貨物如需復(fù)運出境報關(guān)時，應(yīng)向海關(guān)遞交下列單證：（1）《出口貨物報關(guān)單》一式三份；（2）原進口時由海關(guān)蓋印的《進口貨物報關(guān)單》。二、海關(guān)查驗放行。上述單證經(jīng)入、出境地海關(guān)查驗無誤后予以放行，其中，入境時，由海關(guān)在《進口貨物報關(guān)單》上簽章，將二份《進口貨物報關(guān)單》隨進口貨物帶交保稅倉庫。保稅倉庫經(jīng)理人于貨物入庫后，在上述報關(guān)單上簽收，一份留存，一份交回海關(guān)存查。貨主在保稅倉庫所在地以外的其他口岸進口貨物，應(yīng)按海關(guān)對轉(zhuǎn)關(guān)運輸貨物規(guī)定，辦理轉(zhuǎn)關(guān)運輸手續(xù)，貨物運抵后，再按上述辦法辦理入庫手續(xù)。〖說明〗（1）貨主在保稅倉庫所在地以外的其他口岸進口貨物，須按海關(guān)對轉(zhuǎn)關(guān)運輸貨物的規(guī)定辦理轉(zhuǎn)關(guān)運輸手續(xù)。即由申請人填制由海關(guān)統(tǒng)一印制的《轉(zhuǎn)關(guān)運輸貨物準單》，一式三份，加屬國際鐵路聯(lián)運貨物，應(yīng)為貨車裝載清單，也是一式三份，向入境地海關(guān)申報并交驗有關(guān)貨運單證。海關(guān)核準并簽收關(guān)封后將加蓋“海關(guān)監(jiān)管貨物”戳記并加注關(guān)封編號的《海關(guān)運輸貨物準單》，連同關(guān)封一起交承運人，隨同貨物帶交指運地海關(guān)，并按一般貨物的海關(guān)手續(xù)填制《進口貨物報關(guān)單》，并隨附其他有關(guān)單證向海關(guān)辦理進口報關(guān)。（2）保稅貨物經(jīng)批準正式銷售于國內(nèi)市場時，貨主或其代理人須向海關(guān)補辦進口報關(guān)手續(xù)并交納關(guān)稅和工商統(tǒng)一稅，由海關(guān)簽印放行。（3）對從保稅倉庫中提取來料加工、進料加工備料、貨物，貨主須事先持批準文件、合同等有關(guān)單證向海關(guān)辦理登記備案手續(xù)，并填寫來料加工或進料加工專用報關(guān)單和《保稅倉庫領(lǐng)料核準單》各一式三份，一份由海關(guān)留存，一份由領(lǐng)料人留存，一份由海關(guān)簽蓋放行章后交還貨主。倉庫經(jīng)理人憑海關(guān)簽印的領(lǐng)料核準單交付有關(guān)貨物，并憑領(lǐng)料核準單向海關(guān)辦理核銷手續(xù)。（4）保稅貨物復(fù)運出境時，發(fā)貨人或其代理人持《出口貨物報關(guān)單》一式三份、保稅貨物進口時由海關(guān)簽印的《進口貨物報關(guān)單》，向當?shù)睾ｊP(guān)辦理復(fù)運出境手續(xù)。經(jīng)海關(guān)核查與實貨相符后簽印，一份由海關(guān)留存，一份發(fā)還給申報人，一份隨貨帶交出境地海關(guān)，憑以放行貨物出境。